受限于目前疫苗的种类，并无法完全依赖疫苗来预防所有的疾病。凡一种新的疫苗能够核可上市，必定具有一定的安全性与保护力，且要能够有效降低目前疾病盛行率的疫苗，才值得研究发展并推广上市。
而一种疫苗要列为健保的常规接种项目，必须得符合国家防疫政策与经济效益，接种项目也会因医疗现况而调整，例如：水痘疫苗自民国93年起纳入健保给付，而麻疹疫苗则自今年初停止施打。目前仍列为自费项目的疫苗，有些是政府衡量该种疾病在国内的盛行率较低，有些则是尚有其他较经济的传统型疫苗可供选择。
由于目前已是全球化的时代，有些家庭因为工作因素或是异国联姻，会时常带着孩子往返国内外，甚至在外地暂居：而随着国人休闲品质的提升，带孩子出国旅游的机会也大增。在这样的环境与社会变迁之下，相对的疾病的传播交流也更显得复杂。所以在政府未能全面提供免费施打这些自费疫苗之前，如果希望能让自己的宝宝拥有全面性的保护（毕竟疾病盛行率低并不等于没有罹病的机会），或是希望宝宝在接种疫苗之后，能够降低副作用发生的机率，就必须自行衡量是否值得为宝宝编列此笔自费疫苗的预算了。
