宋代已基本定型的风水理论在随后的实践中得到了广泛的运用和深远的发展。明清时期的风水学者，其主要任务是对已有的风水著作做进一步阐释，对来自实践中的问题做进一步总结和提高。因此，这一时期研究和注释风水著作之风大盛。特别是清代乾隆、嘉庆年间，考证之风的兴起，更推动了风水理论研究的发展。众多“辟谬”、“校补”、“笺注”之作不断涌现。
在地学方面，徐霞客做出了很大的贡献。他一生访遍名山大川，虽不是从事风水术，但对岩溶、流水、地貌等问题做出了科学的解释，并完成了著名的《徐霞客游记》。
明末吴江人计成所著的《园冶》一书，曾在日本引起轰动。此书有三卷十篇，卷一是兴造论、园说及相地、立基、屋宇、装折四篇；卷二讲述栏杆，卷三有门窗、墙垣、铺地、掇山、选石、借景六篇。明成祖对风水术有偏好，他曾多次召见风水师，为自己卜寿陵。明代民间普遍讲究风水，以士人为重。清王朝重视陵墓的风水，阳宅建筑也很讲究，颐和园的排云殿就是传说中的风水佳处。
清初考据学盛行，一些学者在地学上也有贡献。顾炎武的《天下郡国利病书》中有《地脉》、《形胜》、《风土》等篇目，对舆地山川进行了探讨。清代民间也很讲究风水。北方人修四合院，大门都开在院子正面的前左角，称为青龙门。这样的结构为坎宅巽门，最吉利，住在这种院子里的人在心理上很容易得到满足。
在《四库全书总目提要》中，几乎对每篇风水著作都做了考证，对当时流行的《葬书》、《宅经》、《玉尺经》、《地理大全》、《地翠总括》等书的作者、成书年代、大体内容等做了较详细的考证和论述，成为相当重要的风水文献资料。
《四库全书》是清乾隆时编纂，是中国古代最大的一部官修书，也是中国古代最大的一部丛书，共分经、史、子、集四部，其中包括很多风水典著，如《葬法》、《宅经》、《撼龙经》等。
